Terdapat jalan metabolik tertentu yang dapat ditentukan untuk mengenal pasti pembinaan molekul tertentu.
Jalur asid scichimic: jalur metabolik sekunder yang mempunyai asid scichimic sebagai pendahulunya, molekul yang mengandung di dalamnya ciri-ciri struktur dan kimia yang dapat dijumpai dalam metabolit sekunder yang berasal dari itu.
Molekul asid scichimic terdiri daripada: cincin 6 anggota, 1 kumpulan karboksilik dan 3 kumpulan hidroksil. Senibina molekul yang sama ini dapat dijumpai dalam metabolit sekunder yang berasal daripadanya, dan yang sebenarnya disebut turunan dari asid. scichimic. Asid scichimic berasal dari penyatuan dua perantaraan dua jalur metabolik utama yang berbeza:
eritrosium-4-fosfat (3C): pertengahan fasa fotosintesis gelap, proses metabolik anabolik;
asid phosphoenolpyruvic (3C): perantaraan glikolisis, proses metabolik katabolik;
Oleh itu, erythrosium-4-fosfat + asid phosphoenolpyruvic = asid scichimic: pendahuluan pertama jalur metabolik sekunder.
Sel mensintesis asid scichimic apabila keperluannya memungkinkan, atau apabila kuantiti dua perantaraan primer begitu banyak dan dapat mengumpul; ini berlaku apabila terdapat jumlah ATP yang mencukupi di dalam sel dan ini melambatkan reaksi katabolisme primer dan anabolisme.
Jalur asid malonik dan mevalonik: kedua-dua prekursor berasal dari molekul Acetyl CoA, oleh itu kedua-duanya mendasari satu jalur: jalur asetat. Acetyl CoA adalah molekul hubungan antara glikolisis dan kitaran Krebs dan oleh itu kita dapat menentukannya sebagai perantaraan metabolisme utama sel.
Kumpulan asetat (kumpulan dengan dua atom karbon) + CoA (koenzim A) = Asetil CoA: molekul kepunyaan metabolisme utama, yang digunakan sebagai blok biologi binaan dalam pembinaan metabolit sekunder.
Laluan asetat kemudian dibezakan dengan jalur asid malonik dan jalur asid mevalonik. Koenzim A bertindak sebagai pengangkutan dua unit karbonat dari sitoplasma ke mitokondria sel, di mana kitaran Krebs berlaku. Karbon sebaliknya diangkut ke tempat lain sekiranya berlaku lebihan tenaga dan boleh menjadi metabolit sekunder yang paling bervariasi; ini mempunyai bilangan atom karbon yang sama sebagai ciri umum, termasuk asid malonik (C4) dan mevalonik (C6).
Oleh itu, jalan metabolik asid scichimic dan asetat mempunyai seni bina molekul yang tepat, yang membolehkan kita mengenal pasti turunan sekundernya dengan mudah. Untuk yang alkaloid, yang mempunyai kepelbagaian seni bina, pengenalpastian pendahulunya tidak begitu mudah; dengan kata lain, tidak begitu mudah untuk mengklasifikasikan satu kategori alkaloid, menelusuri setiap satu kepada satu pendahulu tunggal. Alkaloid sebenarnya mempunyai lebih dari satu pendahulu, kerana ia berasal dari asid amino (sebatian nitrogen primer, yang digunakan sel untuk menghasilkan molekul nitrogen sekunder). Metabolit nitrogen sekunder terutamanya alkaloid, tetapi ada juga molekul lain dengan profil kesihatan yang lebih rendah daripada mereka sendiri, seperti sianogenik glikosida (terkandung dalam badam pahit) dan β-sianos (pigmen) Asid amino adalah sebatian nitrogen yang dipelbagaikan antara satu sama lain dan kepelbagaian ini mencerminkan kepelbagaian turunan langsung mereka, yang merupakan alkaloid.
Satu-satunya unsur kimia yang menyatukan pelbagai kategori alkaloid adalah atom nitrogen yang tertutup dalam cincin heterosiklik, atau sekurang-kurangnya atom nitrogen dengan dua kali ganda elektron bebas yang memberi mereka sifat asas; kereaktifan asas yang sama yang membolehkan kita mengekstrak alkaloid individu oleh anjakan.
Kita dapat meringkaskannya dengan mengatakan bahawa jalan karbohidrat adalah jalur metabolik yang mendasari sintesis semua metabolit sekunder, oleh itu ia merangkumi semua jalan metabolik yang dilihat sebelumnya:
- asetat adalah produk pembongkaran lengkap molekul glukosa;
- asid amino berasal dari proses metabolisme penurunan karbohidrat;
- asid scichimic adalah pendahulu metabolit sekunder, tetapi juga asid amino aromatik (fenilalanin, triptofan dan tirosin);
-Glikosida adalah metabolit sekunder yang terdiri daripada unit gula ditambah tanpa gula, yang disebut aglikon, yang mungkin berasal dari salah satu jalur metabolik yang diringkaskan.
Semua blok bangunan biogenetik dari mana metabolit sekunder berasal berasal dari katabolisme karbohidrat atau dari anabolisme mereka. Gula ini adalah unit gula yang sama yang pernah dikaitkan dengan aglikon merupakan glikosida.
Jalur metabolik asetat dibahagikan kepada pokok biogenetik yang padat, yang mengandungi semua nama metabolit sekunder yang menghasilkannya berbeza, bergantung pada keperluan sel itu sendiri:
- Kitaran Krebs dengan penghasilan akhir ATP (metabolisme primer);
- β-pengoksidaan dan sintesis asid lemak (metabolisme primer);
- Sintesis asid malonat atau malonik (4C), berasal dari penyatuan dua molekul asetat, dan asid mevalonat atau asid mevalonik (6C) yang berasal dari penyatuan tiga molekul asetat. Sel menggunakan dua molekul ini dengan bilangan atom karbon yang sama untuk membina kategori molekul yang berbeza, yang terdiri daripada rantai linear unit hidrokarbon, seperti: asid lemak - digunakan seterusnya untuk menghasilkan gliserida dan lilin - terpenoid, anthraquinones dan steroid.
Artikel lain mengenai "Biogenesis dan ciri-ciri bahan aktif"
- Metabolisme primer dan metabolisme sekunder tumbuhan
- Farmakognosis
- Jalan metabolik asid scichimic